环境监测系统是一种智能化、自动化的系统，这也是其区别于传统环境监测手段的一大优势。就系统的智能化、自动化而言，其短信报警功能极具优势。

环境质量数据瞬息万变，通过人工主动查询环境监测数据，已经远远不能满足对环境监测的实时性要求了，为了提高对环境数据监测的力度和及时度，环境监测系统实现了通过短信报警来监测环境质量数据的功能。只要出现点位离线、某点位数据严重偏离其他点位数据、数据低于检出限等异常情况时，GSM模块就会发送短信给环境监测站的巡检人员，巡检人员在接收到该信息后，就可及时登入环境监测系统，进行人工介入与判断工作。

除了短信报警功能之外，环境监测系统还可以实现手机APP报警功能来提醒人们环境质量变化状况，保证了实时环境监测效果。