在传统的运行管理模式中，环境监测系统的日常运行进行维护、运行质量控制工作等通常均由监测站的工作人员实施。该种管理模式中在实际应用过程中存在的缺陷主要表现在以下几个方面：

1.从管理工作性质角度进行分析，环境监测工作要求工作人员具备较广的知识和技术，专业技术要求较高，主要涵盖电器电路、网络技术、自动化控制等，因此，只有专业知识和技术扎实的工作人员才能完成好相应的环境监测工作。

2.从行政职能角度分析，环境监测系统运行管理人员在数量上也相对较少，因此工作人员的工作内容较为繁重，工作量大。这种现象的存在导致工作人员无法对相关问题进行深入地研究；再次，目前，市场上的环境监测仪器品牌呈现出多样化，缺乏统一性，进而导致环境监测系统的运行管理与质量控制二者无法同时实施，大大增加了工作人员的工作难度；最后，环境监测仪器设备改进、更新速度快，工作人员的专业知识和技能未能得到及时充实和更新，进而限制管理、控制水平的提高。

如上所述，环境监测系统传统运行管理模式存在很多弊端，对于系统管理模式的改进和创新是当下系统行业发展的一大方向。