环境监测系统在长期的运行过程中，不仅要面对环境监测仪器的老化问题，突发性灾害破坏问题，还要面对环境监测人员的流动问题。要应对这些问题就需要制定的一整套环境监测管理办法和技术规范，通过制度化、文件化、体系化的建设来保证环境监测系统长期、稳定的运行。此外，环境监测站的管理人员要敬业爱岗，按制度办事，定期对子站进行维护、校准工作，争取把环境监测仪器的故障排除在萌芽中。管理人员作为环境监测系统管理中最关键的要素，要充分发挥主观能动性，在碰到新问题时，要多向同行或者相关工程师请教，及时解决问题，并且不断积累实践经验，提高环境监测水平。