如今环境监测系统的应用实现了自动监测，监测能力大大增强，远不是传统监测手段能够比拟的。而该系统的进一步发展就是完善自动监测范围了。

在传统的环境监测过程当中，往往会出现这样的情况，上级和下级在同一项环境监测工作中在同一时间内得到的环境质量数据往往都是不同的，造成的现象就是，上级和下级的相关部门之间没有办法提供相互支持。那么如果将环境监测系统应用到实际的环境监测工作当中，就可以使得各个部门实现良好的协调，信息化和智能化会促进环境监测工作质量变得更高，上级下级之间的信息更加对称。

对环境监测系统进行不断完善，对有条件的区域可以增加特征污染因子的自动监测，这样不但能够对各地区主要污染物排放情况进行及时跟踪，而且能够通过较为全面的污染物自动监测使污染减排和环境监管工作得到扎实推进。